Proces sterylizacji w sterylizatorze Enbio, podobnie jak autoklawowanie (w tym media preparatory), to proces termiczny, w wyniku czego zmiany jakościowe pożywki nie różnią się od tradycyjnych sposobów sterylizacji. Jednak skala tych zmian jest znacznie mniejsza, ze względu na wielokrotnie krótszą ekspozycję pożywki na podwyższoną temperaturę. Zmniejsza to w istotnym stopniu stopień dekompozycji wrażliwych na ciepło składników, w tym agaru, którego można stosować znacznie mniej niż przy standardowych recepturach (ok. 30% mniej agaru). W związku z powyższym, niektóre receptury należy dopasować do nowej technologii sterylizacji, co jednak nie jest pracochłonne.
Ważne jest również, że urządzenie ma stosunkowo małe rozmiary oraz wydziela niewielkie ilości ciepła na zewnątrz, w przeciwieństwie do instalacji z autoklawami.